安吉县中医医院建院于1990年，以中医、中西医结合治疗见长，特色突出。医院为浙江中医药大学教学医院、全县中医医疗技术指导中心、县120急救成员医院、浙江省首批中医“名院”项目建设单位、湖州市卫健系统首家博士后工作站，拥有全国基层名老中医专家传承工作室（杨友发传承工作室）。

2013年8月与浙江中医药大学附属第一医院（浙江省中医院）建立紧密型医疗合作关系，成为该院安吉分院，省中专家常年进驻。2015年，双方深化合作共同创建成立“浙北腔镜中心”及“浙北心脑血管病中心”。两中心汇聚两院各学科优势资源、添置国际先进医疗设备，开展各种镜下微创治疗及DSA下冠脉及周围血管造影、支架、起搏器植入、射频消融治疗心律失常等手术，两个中心快速发展，区域优势明显，助力医院成功创建全国基层版胸痛中心、卒中防治中心，并成为中国创伤救治联盟创伤救治中心建设单位。

2018年，县中医医院成为第二医共体牵头医院，下辖七家成员单位。医共体管理模式及创新举措多次在健康报、中国人口报等平台刊登，多次接受国家省市主流媒体采访调研，代表安吉县医共体模式在世行贷款中国医疗卫生改革促进项目构建以人为本的整合型服务体系国际研讨会中接受与会专家现场观摩，获浙江省2021年度县域医共体工作成绩突出集体。